PS2版『タイムクライシス3』には、業務用の移植となる「アーケード」と、家庭用オリジナルとなる「ヒロインシナリオ」の2つのストーリーが存在する。しかも!この2つのシナリオは表裏一体となっているので、両方をプレイしてすることで、『タイムクライシス3』のストーリーの全貌が明らかになるのだ!
ヒロイン役「アリシア」を主人公とし、本編の裏シナリオ的なストーリーを楽しめる1Pプレイ専用の家庭用オリジナルモード。 新戦闘モード「スナイパーシステム」も搭載!
業務用でお馴染みのストーリーが楽しめるモード。選択するキャラクターにより進行ルートが変わるため、1回のプレイでは味わいつくせない楽しさがある。もちろん2人同時プレイ可能だ。
夜の海岸線へ侵入を開始したアリシア。 警備兵が警戒する波打ち際を発見されないように進行していたが… サーチライトの眩しさが、戦闘の妨げに!
◆眩しい敵のサーチライトを破壊すれば、有利に戦闘を運ぶことが出来るぞ!
戦略ミサイルの資料を手に入れるためにはトーチカに近づかなければならない。 しかし敵も警戒を強めており、周囲には見張りの兵士がいる。 スナイパーライフルを構える「アリシア」。
◆これが新戦闘システム「スナイパーモード」!正確さが要求されるステージだ!
VSSEの2人「アラン」と「ウェズリー」がザゴリアス軍の駐留するアスティゴス島に上陸。 海岸から塹壕地帯を抜け、トーチカと戦闘に!
◆敵のトーチカを破壊せよ!
VSSEの情報を入手した「アリシア」は、街中で爆発音と銃声を耳にする。 彼女はジープを奪い、その音が聞こえた海辺へと向かおうとする。
◆逃げ惑う民間人を撃たないように、攻撃せよ!
激しさを増す敵の攻撃! 「アラン」と「ウェズリー」は海岸沿いに漂着した貨物船を発見し、船内に回避する。 しかし敵V・TOLの攻撃により、貨物船が大破。
◆敵V・TOLの攻撃を受け、船体が傾く!
ジープに乗って現れた「アリシア」は、敵V・TOLの攻撃で窮地に陥った「アラン」と「ウェズリー」と合流。 ジープ上での戦闘が繰り広げられる。
◆「アーケード」と対照となるステージ。敵が高速で動き回るので、照準を合わせるのが難しいぞ!
敵V・TOLの攻撃で、窮地に陥る「アラン」と「ウェズリー」。 あわやと言う場面で、「アリシア」がジープに乗って助けに・・・。 ジープに乗って敵V・TOLを迎え撃つ。
◆「アリシア」のジープに乗り込み、敵V・TOLと戦闘だ!
街に到着し、敵本拠地の説明を「アラン」と「ウェズリー」にするが、敵の攻撃にて別行動を取らざる得なくなる。 「アリシア」は、山頂にある列車で落ち合うことを2人に約束する。
◆敵のボスは戦車だ!厚い装甲の戦車にはグレネードが有効!
町に到着し、「アリシア」から敵本拠地の説明を受るが、敵の攻撃で「アラン」と「ウェズリー」は「アリシア」と別行動を取らざる得なくなる。山頂にある列車で落ち合うことを約束する。
◆逆さにぶら下がりながらの銃撃戦!
「アリシア」が辛くも敵の包囲を切り抜けると、今度は敵のスナイパーから狙撃を受ける。 狙撃の名手であるアリシアはこれに対抗する。 スナイパーvsスナイパーの緊張感あふれる戦いが展開!
◆スコープを覗いた瞬間に敵からの攻撃。スナイパーvsスナイパーの緊張感あふれる戦いが展開!
町を抜け、渓谷を進む「アラン」と「ウェズリー」。 敵の激しい攻撃を辛くも切り抜け筏橋を渡りきったところに、滝壷から小型潜水艇が出現!
◆小型潜水艇には敵兵士がひそんでいる!
兄「ダニエル」と潜入した仲間「ジェイク」と合流する「アリシア」。 しかし、「ジェイク」は裏切り者だったのだ! 逃げる「ジェイク」を「アリシア」が追う!
◆卑怯者「ジェイク」は民間人を盾に逃走!民間人を撃たないよう注意しろ!
「ジェイク」に逃げられた「アリシア」は、貨物集積所で「アラン」、「ウェズリー」と合流。 しかし潜入した貨物列車にも既に敵の手が回っていた。
◆背後から迫り来る装甲列車!かなり手強いぞ!
貨物集積所にて「アリシア」と合流し列車は出発する。 しかし列車にも敵の手が回っていた。 鉄橋は破壊され、3人を乗せた列車は谷底へと落下!
◆敵の攻撃をかわしつつ、落下する車両を駆け上がれ!
破壊された鉄橋から落ちつつある列車。しかも敵の狙撃部隊が対岸から攻撃を仕掛けてきた。 ライフルで立ち向かう「アリシア」。
◆敵は先頭車両の「アラン」と「ウェズリー」を狙っている。「アリシア」の腕の見せ所だ!
処刑されかけている「ダニエル」を助けるため、陽動として「アラン」と「ウェズリー」は敵の囮に、そして「アリシア」は狙撃ポイントへ向かう。 息を呑む攻防戦が展開する。
◆兄「ダニエル」が処刑されようとしている!狙撃ポイントへ急げ!
古城の城壁から基地の様子を伺うと、独立解放軍のリーダーで「アリシア」の兄でもある「ダニエル」が処刑寸前! 兄を救いだそうと焦る「アリシア」。 「アラン」と「ウェズリー」は、囮となり、敵を引つけることに。
◆「ワイルドドッグ」と「ワイルドファング」の2大強敵が立ちはだかる。
「アリシア」が狙撃ポイントに到着すると、そこには、敵「ゾット」将軍に「ダニエル」を盾に取られ、身動きが取れない「アラン」と「ウェズリー」の姿が・・・。 「アリシア」は、ライフルを構えた!
◆与えられた時間は僅か5秒。「ゾット」将軍の拳銃を狙い撃て!
無事狙撃に成功し、間一髪兄「ダニエル」を助け出した「アリシア」。 彼女は収容所に囚われている仲間の救出に向かった。 「アラン」と「ウェズリー」は、逃げた「ゾット」将軍に追撃をかけるため別行動を取る。
◆"SHOOT"表示されているドアを撃ち、仲間を救出するのだ!
宿敵「ワイルドドッグ」、「ワイルドファング」を倒し、「ゾット」将軍を追いかける「アラン」と「ウェズリー」! 「ゾット」将軍は逃れるために、自ら基地に爆弾を仕掛けた。
◆燃え盛る炎の中で、激しい戦闘が繰り広げられる!
救出した仲間とともに、敵に包囲され窮地に陥っていた「アラン」と「ウェズリー」を助け出す「アリシア」。 逃げ出した「ゾット」将軍を追跡中、裏切り者「ジェイク」と遭遇する。 「ジェイク」の逃走用V・TOLとの戦闘が始まる。
◆「アリシア」と「ジェイク」の最期の死闘。まさにクライマックス!!
「ゾット」将軍を追い詰めた「アラン」と「ウェズリー」だが、逆に敵に包囲され窮地に陥ってしまう。 しかし、「アリシア」とレジスタンス部隊が登場し、間一髪危機を免れる。 「アラン」と「ウェズリー」は、ミサイル発射場に逃げ込む「ゾット」将軍を再び追い詰めた!
◆「ゾット」将軍との最後の決戦だ!